El curso trata sobre la degradación por diferentes tipos de microorganismos de los principales componentes de los residuos vegetales: la celulosa, hemicelulosa y lignina. Se describen en primer lugar su composición química y su distribución para que el alumno comprenda mejor los procesos enzimáticos que los microorganismos, tanto hongos como bacterias, han desarrollado para degradarlos. Se estudian los enzimas implicados en estos procesos repasando el mecanismo de acción de las diferentes proteínas implicadas, su regulación y la relación estructura-función. Se repasan los últimos avances en biotecnología de dichos enzimas o de los microorganismos y las principales aplicaciones de estos procesos de biotransformación tales como:

• Obtención de combustibles alternativos o fertilizantes naturales a partir de residuos lignocelulósicos
• El uso de tecnologías limpias en la industrial papelera, textil y en el reciclado del papel que permite no sólo el ahorro de energía sino que evita el uso de blanqueantes químicos y genera aguas residuales menos contaminantes.
• La aplicación de microorganismos ligninolíticos o de sus enzimas en el tratamiento de aguas residuales que contengan residuos vegetales u otros compuestos recalcitrantes.
  Por último se dará una visión de futuro de las posibles aplicaciones tanto de los enzimas como de los microorganismos implicados, que varían desde la obtención de compuestos químicos hasta construcción de biosensores.